主人公苏醒后已置身于遍布荒漠的现代世界。尚未及诧异，青梅竹马的崇便以敌人的姿态出现在面前，并向其发起了攻击。原本天真烂漫的少年跟随着可怕的怪物，仇视着身为神子的主人公，此情此景令伙伴们瞠目结舌。但是，主人公却仿佛对眼前情景似曾相识。 自己应该已经拯救过两个世界——？ 不断复苏的前尘往事冲击着主人公，为了躲避崇的攻击，最终借助龙神之力而穿越到了异世界。 然而，迎接她的却是一个名叫“リンドウ”的神秘男子，以及与自己所知历史大相径庭的异世界的幕末时代。 在崭新的历史中，即将遇到富有魅力的同伴，迎接不解之谜，以及邂逅尚未可知的爱情。这次一定为了心爱的人们守护住未来—— 主人公需做出决定，把握住每一日的动向。主公人将徘徊于龙神神子的使命与少女的情怀之间……
（1）两个世界息息相关！ 【时空沙漏系统】 本作强化了“两个世界”的联系。在异世界的江户地图中的行动会对现代地图产生影响。“两个世界”更加生动，玩家可以在本作中体验独特的剧情魅力。 （2）在新地图展开的新故事 玩家可以在本次新登场的舞台上展开崭新的故事。故事以江户城为中心，在新地图展现幕末时代江户城的风貌，栩栩如生地描绘了全新的故事。
